2009年9月29日，国家科技部下发了《关于确定武汉大学技术转移中心等58家机构为第二批国家技术转移示范机构的通知》（国科发火[2009]555号），公布了第二批国家技术转移示范机构的名单，我校现代轨道交通研究院榜上有名，这是我校第一个国家级科研机构。
为贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020年）》，积极发展技术市场，加强技术转移机构建设，大力推进自主创新，加快建设以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系，根据《国家技术转移促进行动实施方案》和《国家技术转移示范机构管理办法》，国家科技部在2008年年初组织开展技术转移示范工作，旨在通过选择和扶持引导不同类型、不同发展模式的技术转移机构进行试点，创建一批国家技术转移示范机构，带动技术转移机构的健康发展，提升技术转移机构的整体服务能力。
经各省、自治区、直辖市、计划单列市科技厅（委、局）、国务院有关部门推荐和专家评审，此次全国共有58家机构获批国家技术转移示范机构。截至公布日，全国共有134家机构获批国家技术转移示范机构，首批76家，包含19所高校技术转移机构，其中隶属于“211”工程高校17所（“985”工程高校13所），非重点院校2所；第二批58家，包含16所高校技术转移机构，其中隶属于“211”工程高校13所（“985”高校7所），非重点院校3所。在辽宁省高校技术转移机构中，获批的为大连理工大学技术转移中心有限公司、东北大学技术转移中心和大连交通大学现代轨道交通研究院。
国家创新体系主要由知识创新体系、工程技术创新体系和哲学社会科学创新基地三座金字塔和一个成果转化与服务平台组成。其中，知识创新体系的顶层为国家实验室和大科学中心，中层是国家重点实验室，底层为省部级重点实验室。工程技术创新体系的顶层为国家工程研究中心和未来的国家工程实验室，下层依次是国家工程技术研究中心和省部级工程（技术）中心。第三个金字塔就是哲学社会科学创新基地，而一个平台就是成果转化与服务平台，包括大学科技园、技术转移中心等。
国家技术转移中心是以拥有人才和技术优势的部分高校为依托，组织和整合高校高技术研究开发资源与产业相结合，推动先进技术向企业生产领域的转移，加速科技成果转化和高新技术产业化国家基地建设。国家技术转移中心作为高校组织和整合科技资源的机构，将主要担负5大任务，即开发和推广共性技术，推动和完善企业技术创新体系建设，促进高校科技成果的转化及技术转移，加强国际技术创新合作，为企业提供综合服务。其主要的工作要求是：按照中介机构的方式运行，在实践中不断探索技术转移中心的运行机制和发展模式；充分利用现有技术优势和科技资源，在科技成果转化和产业化方面积累成功的经验；形成共性、关键性技术的开发和扩散的有效机制；在充分发挥自身综合优势的同时，要与其他高等学校和中介服务机构进行广泛的合作，为企业技术创新提供良好的服务，并对其他高等学校科技资源进入企业起到示范和导向作用；培育专业化技术转移人才队伍。
现代轨道交通研究院成立于2005年11月18日，本着“以服务求支持、以贡献求发展、以特色求突破”的理念，紧紧抓住中国铁路跨越式发展和振兴东北老工业基地的战略机遇，近四年来，先后与国内十几家知名企业、科研院所建立了科研合作关系，签署了22份校企合作协议，实现技术转移项目140多项，技术转移服务金额3000多万元，争取各级政府资金支持达3819.8万元，企业设备支持总额1960万元，建立了6个“产学研”合作平台、5个公共科技服务平台、5个省部级工程中心和5个省级重点实验室。现代轨道交通研究院自成立以来走过了一条从企校合作到官产学研合作直至纳入国家技术创新体系的螺旋式上升发展道路，这次成为我国铁路行业及相关领域技术转移的首批示范机构，必将为我校产学研合作的快速发展奠定坚实的基础。我们将依据《大连交通大学2009-2020年特色发展规划》的要求，充分利用这一有利条件，抢抓机遇，全力推进产学研合作工程的建设工作，为我校的科技创新工作做出更大贡献。